Registracija poslovnog subjekta se vrši putem linka “Registracija korisnika” koji se nalazi na početnoj stranici PRTR aplikacije. Nakon što se popune osnovni podaci o poslovnom subjektu i pošalje zahtjev za registraciju, potvrda o uspješno predatom zahtjevu za registraciju će biti dostavljena na zvaničnu e-mail adresu poslovnog subjekta. Nakon što nadležna institucija izvrši provjeru zaprimljenog zahtjeva i odobri registraciju, na e-mail adresu će biti dostavljena potvrda o uspješno završenom procesu registracije, sa uputama za kreiranje i aktivaciju korisničkog naloga za pristup aplikaciji.